| -
katjonbytare, CM-Sepharose CL 6 B, i buffert A
-
affinitetsmedium, Affi-blue, som i buffert A binder albumin
-
gelfiltreringsmassa, Sephadex G 25, i buffert A
Provlösning:
albumin 25 mg/ml, blå dextran 5 mg/ml,
cytokrom c 2 mg/ml och DNP-glycin 2,5 mg/ml
lösta i 0,02 M fosfatbuffert pH 7,0
Ninhydrinlösn:
ninhydrin 4 mg/ml etanol (eller aceton)
Buffertar:
A: 0,02 M
fosfatbuffert, pH 7,0
B:
buffert A med tillsats av fast NaCl till en konc av 1,4 mol/l
C:
buffert A med tillsats av fast urea till en konc av 6 mol/l
D:
2 M tris, pH>10
Övrigt: pastörpipetter,
eppendorfrör
Utförande:
Fäst
hållaren av plast vågrätt i ett stativ och sätt i de tre kolonnerna.
Plocka bort locket och den nedre ”pluggen”.
Eftersom kolonnerna
levereras med överskott av buffert A, låter man först detta rinna ut (vätskan
slutar att rinna ut då pelarens yta torrläggs).
Sätt 0,5 ml provlösning på
CM-Sepharose-pelaren och låt den
tränga in i pelaren.
Sätt ca 0,5 ml buffert A på pelaren och
låt den tränga in.
Börja samla upp eluatet efter den tredje blå
droppen.
Sätt på ytterligare 2 ml buffert A och fortsätt samla eluatet
i samma rör som tidigare upp till 1 ml.
Fortsätt samla ca 1 ml
fraktioner tills eluatet är ofärgat. Cytokrom c sitter kvar på pelaren medan de övriga föreningarna har
eluerats ut.
Välj ut den fraktion, som har starkast färg för att sätta på
Affi-blue pelaren.
Cytokrom c elueras genom att sätta lösning D
(Tris-lösningen).
Sätt på den starkast färgade 1 ml fraktionen från
jonbyteskromatografin
på Affi-blue-pelaren.
Sätt ca 1 ml buffert A droppvis på pelaren
och låt det tränga in.
Tillsätt mer buffert A och samla upp eluatet i
1 ml fraktioner tills eluatet är ofärgat. Det är viktigt att
eluerings-hastigheten inte är för snabb, då kan resultatet bli att albumin fäster
dåligt och det blir problem att påvisa albumin i eluatet när pelarmassan
senare elueras.
Albumin binds till Affi-blue-massan, medan de övriga två föreningarna
elueras ut i de första 4 - 5 fraktionerna. Välj ut den fraktion som har
starkast (grön) färg för att sätta på gelfiltreringsmassan.
Eluera ut albuminet genom att tillsätta buffert B (fosfatbuffert med
NaCl) till Affi-blue pelaren och samla upp
10 st 0,5 ml fraktioner
OBS!
Det krävs en mycket långsam elueringshastighet för att albuminet ska släppa från Affigel-massan. Detta kan åstadkommas genom
att man tillsätter elueringsbuffert droppvis med hjälp av pastörpipett på
pelaren.
Tillsätt 0,5 ml ninhydrinlösning till samtliga rör och och koka i
5-10 min. (Obs stick hål på eppendorfrörets lock före kokningen)
Notera färgförändringen.
Sätt på 0,5 ml av den gröna fraktionen från affinitetskromatografin på
Sephadexpelaren och låt det tränga in i pelaren. Sätt ca 1 ml av buffert A på
pelaren och låt det tränga in. Tillsätt mer buffert A och samla upp eluatet i
1 ml fraktioner tills eluatet är ofärgat.Notera färgseparationen på
pelaren.
Dextran blue elueras ut först och därefter DNP-glycin.
Regenerering:
CM-sepharose: Ca 40 ml av buffert A får långsamt rinna igenom pelaren
Affi-blue:
Ca 10 ml av buffert C (buffert A med tillsats av urea) får långsamt rinna igenom pelaren.
Låt sedan 10 ml av buffert A rinna
igenom.
Gelfiltrering: Tvätta med buffert A tills pelarmassan är helt färglös.
Vid långtidsförvaring av kolonnerna kan man
tillsätta NaN3, natriumazid
(gift!), till en konc av 0,05%
till buffert A för att förhindra bakterietillväxt.
Lägg upp eppendorfrören (på flödesschemat) och diskutera vilka
kromatografiska principer som tillämpas för var och en av de tre olika
kromatografimassorna.
|